蓝色的海面上微波荡漾,海鸥轻巧地掠过海面,在水上自由地飞翔。一条白色的海轮在破浪前进,这是我国第一艘万吨海轮“民主十五号”在试航中。在国庆节来临的时刻,“民主十五号”完成了四十几个小时的试航,我国的第一条万吨轮试制成功了。刘厂长和王万水师傅站在船台上,回忆起了三个多月以前的往事。那时,这条船还是一个空壳,向国外订购的3000匹马力的内燃机迟迟未到,而我国又暂时不能制造,船体在水中已经浸泡了八个多月,一直不能开工,刘厂长心里十分焦急。一天,他被王万水师傅拉去看一张大字报……。午夜12点,在繁华都市的一个小角落,一家食堂才刚刚开始营业。这家深夜食堂的老板(小林薰 饰)虽然脸上带着伤疤,却是一个温情且厨艺精湛的男人。虽然小店里的菜谱很简单,但是只要是客人想吃的都可以点,所以小店备受底层小市民的喜爱。延续第一季的风格,深夜食堂里每晚都上演一个耐人寻味的故事,每个故事的主角都有自己钟爱的一款美食。特别值得一提,第一季曾出现的红色香肠再度登场,其中埋藏多年的往事随之揭晓,曾经的故人再度聚首,又展开了一个崭新的温情故事……
《深夜食堂》在2006年开始连载,由于作品气氛浓郁、风格特殊,二度改编日剧播映,由小林薰担任男主角。隔年获得“第55回小学馆漫画赏”及“第39回漫画家协会大赏”。。