1943年秋天,东北被日本鬼子侵占了,东北抗联部队奉党中央之命参加抗日战争,二方为扩充各自的势力,都对着狼窝山上的土匪窝相互较着劲。而土匪头目许金贵带着宁做鸡头不当牛后的思想,最终在日本鬼子劝降不成而被日本军恼羞成怒地把狼窝山给毁灭了,使得从抗联部队前来的党代表赵彦、老李头也被当作“肉票”关进集中营。关进集中营的日子,鬼子的残忍变本加厉。一个大风大雨之夜,由赵彦等人策划的越狱暴动开始了,冲出层层重围的赵彦、许金贵、“马脸”、金娃、龟田等人飞奔着越过中苏边境,刚刚逃出,却又被苏军部队瓦丽娅抓住,被投进苏军监狱。不久苏联政府准备对日宣战,美国在日本的广岛、长崎投下了原子弹,日本无条件投降。赵彦终于和瓦丽娅在一起了。但由于没有《侨民证》和《国民证》又得面对新的流亡。在贫病交加和生活极端的困境中,赵彦他们在辗转流亡了十来个年头,再也无力与死神抗衡,长眠于西伯利亚的土地上。许金贵在坚持下,回到了祖国的怀抱,当他再次来到当年逃过边境的那片洼地时,山野到处盛开着烂漫的山花,而山谷里却静得听不到一丝风声。。赛菲罗斯的事件已经过去2年了,人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍,但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德,却过着与世隔绝的生活。
但是,神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法•洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时,眼前这个人,只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。
以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前,文森特不得不再次挥动双枪,保护大家。而世界的英雄,克劳德,能否再次振作,守护这个世界呢?。