中士约翰·金利(杰克·吉伦哈尔饰)最后一次在战场上执行任务,在他和当地翻译艾哈迈德一起调查该地区时,他们的部队在巡逻中突然遭受到伏击,幸运的是,两人还活着,不幸的是,只有他们两人成为了幸存者。在伏击中金利受了重伤危在旦夕,这无疑增加了他们的逃跑风险,在敌人穷追猛打的追击下,艾哈迈德冒着生命危险带着受伤的金利穿越数英里岖崎地形,终于到达安全地带。回到国内后,金利得知艾哈迈德和其家人并没有像承诺的那样获准离开战区,他决心报恩并保护艾哈迈德及其家人,他重回战区在当地民兵到达之前救出艾哈迈德一家。。主人公の少年ユウキ・コスモら地球人が移民したソロ星で、第六文明人の遺跡が発掘された。遺跡の文献からフォルモッサ・シェリルが導き出した名を取り、発掘された巨人ロボットはイデオンと呼ばれるようになる。 そのイデオンは、異星人バッフ・クランの伝説でイデの巨神として語り継がれていたものだった。イデ捜索隊隊長のギジェ・ザラルに無断で、カララ・アジバが調査のためにソロ星(ロゴ・ダウ)へ向かう。 コスモ、ジョーダン・ベス、イムホフ・カーシャがイデオンを操縦するが、二つの人類は双方とも相手を異星人と呼び、恐れ、自分の星を守るために異星人を殲滅しようとして戦火を拡大させた。 コスモ達はソロ星を捨て、イデオンの母船ソロシップに乗って宇宙を逃亡する。。