友引高中即将迎来新一年的学园祭,上到老师,下到学生,却都为了这个重要节日而忙碌。虽然应名还有最后一天的准备时间,但是日复一日,年复一年,学园祭开幕式却迟迟未能举行。疲劳的温泉老师从中感到蹊跷,他感到自己与周围的人每年都过着同样的生活,却丝毫未能察觉奇怪之处。温泉将这个想法告诉了樱花老师,两人商议命令天天泡在学校的学生们回家,可是无论如何兜兜转转,面堂等人最终还是回到了学校门口,而留守的温泉老师也就此失踪。经过数日同样的诡异生活,面堂、阿当等人同意与樱花老师成立事件真相纠察小组,大家一同进入了时间和空间分外诡异的友引高中……
本片根据漫画家高桥留美子的原作改编,是该系列动画的第二部电影版,导演押井守对影片的全新诠释却引起了原作者的不满。。故事从一场婚礼开始,驳船亚特兰大号的船长迎娶了漂亮的乡下姑娘朱丽叶。婚后,朱丽叶开始了全新的船上生活。一开始她对船上生活感到新鲜有趣,和丈夫的相处也甜甜蜜蜜,然而很快她便厌倦了这种单调枯燥的生活,渐渐地向往起大城市巴黎的热闹繁华。船长为了满足朱丽叶,将亚特兰大号开往巴黎。
然而期间发生种种波折,导致船长迟迟没有带朱丽叶去巴黎,二人的矛盾日渐加深。不久,朱丽叶悄悄离开了亚特兰大号,独自去了巴黎,船长得知后生气地驾船而去。分开后船长对朱丽叶无限思念,终日神不守舍。孤零零一人流落在巴黎的朱丽叶,最终会选择留在灯红酒绿的巴黎,还是回到亚特兰大号上,回到深爱自己的丈夫身边?。