在上一集中,爱丽丝救出了被冷冻的同伴们,众人在离开之际却被赶来的雇佣兵赶尽杀绝。T病毒使红皇后的程序发生了错误,变得残暴嗜血的她想要杀死最后的人类毁灭地球。唯一能够阻止红皇后的只有爱丽丝一人。而此刻,失去了能力的爱丽丝却被保护伞公司囚禁在位于海底的秘密基地中。威斯克通过病毒侵入了保护伞公司的系统,他放走了爱丽丝并告诉她,她是人类最后的希望,而为了拯救人类,他们必须冰释前嫌共同抵抗更强大的敌人。爱丽丝遇见了保护伞公司的前员工艾达·王,两人一路上奋勇杀敌结下了深厚的友谊。同时,爱丽丝旧日的战友们也组成了一个小分队,从外向内进行突围。
保护伞公司在海底建造了逼真的模拟城市,并使用克隆人作为T病毒的实验对象,为了抵达出口,爱丽丝一行人必须穿越东京、纽约、华盛顿和莫斯科四座城市,而每座城市中都有丧尸们在蠢蠢欲动。。说明一下吧!以世界和平为目标的英雄战队“杰拉特5”的队长·相川不动,与企图征服世界的秘密结社“格格车”的战斗员队长·“死神公主”祸原死亡美。宿敌之间的他们,有着超越组织之墙的深深因缘!!其实这两个人…在交往!两人没有向社会和朋友公开,开始秘密交往。但是,对于恋爱初学者的纯洁的二人来说,一切都是新的。一旦被发现,比赛就结束的禁断的爱情喜剧开始了。