2015年,配以电脑为导航系统的赛车比赛-Cyber Formula,取代了F1(一级方程式)成为21世纪世界最高水平的赛车赛事。14岁的少年风见隼人在护送父亲生前设计的赛车“阿斯拉”(ASURADA)到日本富士冈赛车场途中受到不知名的攻击,危急之下被迫驾驶“阿斯拉”,却因此被系统记录为唯一赛车手,不得不与职业赛车手新条直辉、布里德•加贺、卡尔•里婿特•冯•兰德尔等人一起角逐新世纪的赛车冠军。一站站的赛车比赛,不仅有赛车手之间的竞争,更有与青梅竹马菅生明日香之间的羁绊,风见隼人从此展开了新世纪GPX史上最年轻的冠军传说。。一天,宇宙开发中心的上空发现了来历不明的太空母舰,一名神秘女子出现,随后城市受到了外星机器人的袭击。高斯奥特曼及时出现打败了外星机器人,结果又出现了2台外星机器人,高斯陷入危机。武藏看到高斯陷入危险,主动与高斯合体,利用技能让2台外星机器人停止行动。就在此时杰斯提斯奥特曼忽然出现,他不但启动了两2台外星机器人,并且还和2台外星机器人联手杀死了高斯。
这名神秘女子来到地球不是为了维持宇宙的秩序,而是要把地球上所有生物全部消灭!为了自救,世界各国想尽所有办法去解决眼前的危机。地球即将毁于一旦,大家没有一点办法,除非奇迹出现。然而,武藏的亲人和队友任坚信高斯和武藏还未死去,他们四处奔走寻找,希望奇迹真的能够出现!。