废物之镇毕哈拉的垃圾山从码头蔓延到沼泽,街上到处都是光着脚的脏小孩。十四岁的男孩拉斐尔靠捡垃圾养活一家人,有一天拉斐尔和好友加多捡到了一个小袋子,里面有一个皮夹、地图,以及一把钥匙。皮夹里装着一大笔钱,然而拉斐尔并没有想到他的人生很快就被改变了,警察找上门利诱他交出袋子,原来袋子里藏着政府腐败的证据……几个垃圾男孩,如何能揭发世界上的不公不义?。テレビアニメや実写映画など様々なメディア展開で人気を集めてきた大和和紀原作の大ヒット少女コミック「はいからさんが通る」を新たなスタッフ&キャスト陣で映画化した劇場版アニメ2部作の後編。大正時代。女学生の花村紅緒は伊集院忍少尉と出会うが、彼が自分の許婚であることを知って反発する。やがて2人は許婚という関係を超えて惹かれ合うが、少尉は戦地で消息不明になってしまう。少尉の生存を諦めきれない紅緒の前に、少尉と瓜二つのロシアの亡命貴族サーシャ・ミハイロフが現われる。愛する人と同じ姿でありながら自分のことを全く知らないサーシャにショックを受ける紅緒を支えてくれたのは、彼女が働く出版社の編集長・青江冬星だった。そんな中、驚くべき事実が次々と明らかになり、彼らは歴史的大事件に巻き込まれていく。。