一架老旧的波音747飞机准备进行其最后一次夜间飞行,载着仅有的九位乘客从位于太平洋中心的好运岛飞往新加坡。由于乘客的锐减,该航线已经被取消。飞机起飞后,怪事便不断在这趟最后的航班上发生,先是土著老太突发癫狂非要带孙女下机;又是商务舱电视屏幕离奇中断;接着又是自闭症女孩举止诡异,最后连空姐杰西卡也神秘失踪……不安的气氛开始在机舱里蔓延,直至杰西卡被发现惨死在洗手间,身上留有奇怪的伤痕,飞机上仅有的十四个人开始陷入恐慌之中,而这时危险也正一步步地逼近……。一天,工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤,与朋友们一起来到了数码世界,在那里认识了众多的数码兽同伴并且成为指挥官建立“Xros Heart”团队。意想不到的是,在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类在数码世界中活跃着……然而,为了防止邪恶的巴古拉军企图称霸数码世界,他们将要努力地收集水晶(Code Crown)来保护各个领域(Zone),担负起拯救数码世界的命运。 被巴古拉兽击回到人类世界的工藤大器和高吼兽,经过东京大决战留在人类世界一天后,相对地数码世界已经过了好几个月的时间,并落入了巴古拉军支配下的地狱世界,分裂为七个国家(Land),由七名巴古拉军手下的死亡指挥官所统治,而这七名死亡指挥官就是本篇章的主要敌人。为了让数码世界再次得到和平,工藤大器和高吼兽决定再次回到危机四伏的数码世界中。此外,本篇章亦出现全新力量“超进化”。 与巴古拉兽的最终决战...。