如果突然有一天,当你打开电子邮件收件箱时,一瞬间你的脑子里记下了那一闪而过的所有国际机密,对你来说是上天的眷顾亦或是噩梦的开始呢?至少对于 Chuck来说这是他新生活的开始。一个电脑天才却只能在超市里给顾客修电脑,不时的要跟那个尖酸刻薄的老板对着干,但是又时刻担心着自己的饭碗不保。曾经的计算机高材生如今却只是一个小小的超市雇员,曾经的同学早已经是硅谷的千万富翁,而自己却还要跟这姐姐住,对于Chuck来说除了自卑还是自卑,唯一的快乐或许就是和死党Morgen斗斗嘴,和Buy More的其他几个死党扯家常。但是这样的生活注定不会发生在Chuck身上,因为上天不会埋没他的天分。一个偶然机会Chuck打开了那封邮件,于是他的人生发生了翻天覆地的变化。Sarah和Casey的闯入使Chuck一夜之间由名不见经传的小人物摇身一变成为了神秘的间谍。但这个间谍不仅糊...。神秘的EVA零号机驾驶员绫波丽,在与碇元度约定之时,来到了NERV底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。
在危急时刻,葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完计划”的探查工作,还要保护碇真嗣与明日香,以及防备SEELE 对初号机与二号机的物理接触。
出于对碇元度的憎恨,赤木律子接受了SEELE引爆MAGI的提案,她能否成功?长期与SEELE共事的碇元度、冬月耕造、碇唯,为了防止人类“最终的悲剧”,而酝酿了的“人类补完计划”能否实现?尽在《新世纪福音战士》电影版第2部中解答。。