城北大学学生·筑波洋在练习滑翔机的时侯帮助了被不明组织追赶的改造工学者·志度博士。博士曾是与企图征服世界的组织·新修卡的合作者,但由于组织的残忍做法而令博士的良心受到谴责,从而选择逃离新修卡。洋为了匿藏博士而被新修卡的怪人打至垂死。博士为了救活洋而回到了新修卡,并把洋改造为改造人。 复活后的洋与博士一起逃离了新修卡。而为了保护人类,洋变身了,博士将变身后的洋称作“假面骑士”。。沈知离为复活师傅凭古方寻找药引,而苏沉澈到访却让沈知离陷入时间循环,沈知离发现苏沉澈身死时光就会倒流,为顺利找到药引二人一同上路,默契和误会接踵而来,还有神秘人暗中指引,两人能否破解时空之谜找到药引?。