三十年代的泰国正被日本占领。七名地下战士,在泰国警方和日军的追捕下,他们的目的是为了救出一位被逼婚的美丽女子。而更重要的,就是要破坏日军的铁路桥。20世纪末,世界各地的天才少年组成了一个名为"炼金之星"的组织,其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员,靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后,投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性毁灭招来体"进行的誓死决战中;另一方面,已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为:对于地球而言,人类才是真正的癌细胞。他凭着"蓝光"的威力,变身成与"盖亚"相对立的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏,盖亚·奥特曼其最大的变化在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人出生的"人类奥特曼"的登场。当然,他俩的战斗场面也属前所未闻。同时,二人的对立观点贯穿前半段,因此前半段贴近于连续剧。该剧主要分为三个单元,整个剧情不仅有着案件悬疑的精彩剧情,同时也有很多让人觉得温情感人的部分,罗三拐和罗妻,两人都是非常善良并且极具同情心的人物,两人养育的四个孩子中,有两个孩子并非是自己亲身的,令原本就不富裕的两人负担变的更重,但是两人都没有放弃,罗三拐为此也更加努力,并且将自己也改造成为新中国合格的人民警察。。