世纪之交的年代,我国沿海的东海市。由WO环球贸易开发公司融资兴建的太平洋娱乐城落成,董事长兼总经理司马洛奇从海外飞抵东海市,市中院执行局局长赵杰根据法院判决,前去查封娱乐城,遭到不明真相的群众和保安的殴打。《东海日报》记者谢亮报道了此事,市长金海涛批评中院对司马洛奇一案判决,记者谢亮找赵杰道歉,为自己的失实报道深感内疚并表示愿做赵杰的同盟军。司马洛奇行贿原省委书记夫人苏影,通过苏影的巴结上了董平副省长。 市长秘书夏志伟的恋人方艳萍刚从政法大学毕业,亲自主持盛大的开业大典。东海市中级法院执行局局长赵杰率领执行人员查封娱乐城,追缴WO公司久拖不还原东海塑料厂等几家债权的欠款。在司马洛奇等人的暗中指挥下,赵杰等人遭到不明真相的保安和农民的围攻和殴打……。正享受短暂假期的公安九课少校草薙素子(坂本真绫 配音)突然接到巴特(松田健一郎 配音)的报告,西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击,政府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下,九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人通力合作,将恐怖分子彻底制服,但草薙在行动中意外受到神秘病毒感染。在西之内恐怖袭击的同时,远郊的水坝发生爆炸案。新滨县刑警陀古萨(新垣樽助 配音)传唤水坝管理企业负责人沙特博士,对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压,陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面,草薙一方得知恐怖分子的真实身份,正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件意外联系在一起,其背后隐藏怎样的真相?
本片根据士郎正宗的原作改编,为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。。