当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时,约翰.哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后,索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇,他重新找到马科姆博士,邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸,他断然拒绝哈蒙德的提议,但当得知女友莎拉已前往小岛之时,只得跟随探险队整装出发。
在索纳岛上,另一组野蛮的探险队已经先期到达,他们抓捕恐龙将其买到外国。利欲熏心使得这些贪婪之徒全然不顾危险,竟然打起暴龙的主意。索纳岛旋即变成恐怖的屠杀地狱……。博物馆导游泰德热爱自己的工作,其博学热忱的讲解博得了带学生来此参观的漂亮女教师麦琪。老馆长却宣布了一个不幸的消息:由于参观的人数太少,博物馆面临着关张的窘境,唯一的拯救办法就是推出一项其他博物馆前所未见的新奇展品。老馆长出示给泰德一本带有地图的神秘日记,表明非洲扎格瓦部落迷失的一处圣陵所在,只要从中带回一尊大型神像,博物馆就有救了。泰德乘着轮船向非洲出发,到了丛林后找到了地图所示的古老神像,但完全不像老馆长描述的那样宏伟。而此刻一只顽皮的小猴对泰德发生了兴趣,一直尾随着他。在泰德动身离开非洲时,小猴子也悄悄跟上了船。回国之后泰德接连遭遇了无家可归、继而失业,与这只小猴相依为命并为它起名乔治。最终泰德能不能找到传说中的神像?博物馆又是否能继续维持?。