无间道长风烛残年,但为镇魔伏妖长年累月驻守青峰山,守住魔洞出口。十年之约来临,黑将军现身与无间道长大战数十回合,虽然难分高下,却两败俱伤,黑将军因元气大伤而化为婴孩,无间道长内伤严重知时日无多,就将毕生功力传授随身爱徒无邪,并要无邪将婴孩抚养成长,归入正派,重整神剑门。数年后太子夜视天象,见天有异像,急召神剑门无邪出征灭魔并派朱雀,玄武随行。在众门徒长老反对下无邪坚持带师弟无界前往青峰山,一来见识外界,二来作一个考验,看无界是否有魔之缘,无界虽然是魔之子,长大后人品纯良不爱学武却爱学医。前往青峰山脏洞,鬼泉镇是必经之路。鬼泉镇荒凉无人,无邪、无界、朱雀及玄武决定在鬼泉镇渡宿一晚,明早再入青峰山,暗黑邪王终于出现,并掳走无界……。故事发生在一个电脑科技极为发达的年代,一名科学家发明了一个杀人程序协助警方办案,其中集结了数百名连环杀手的资料和他们的作案手法。这个程序是如此的邪恶,最后不仅生成了个人意志,更拥有了人类的外表和可以随时修复任意损伤的特殊能力,它从禁锢中逃脱了出来,在世间作恶。
为了捕捉这位邪恶的“凶手”,警方设计了一个追踪仪器,罪犯帕克(丹泽尔·华盛顿 Denzel Washington 饰)被选中成为了仪器的试验品。帕克曾经亦是一名警察,却因为动用私刑杀死了让他家破人亡的杀手而被免除了职务打入大牢。而让帕克感到在意的是,在杀人程序中,亦有当年杀害他家人的那名杀手的存在。。