一个私企老板立志要建立一个非同寻常的公园:恐龙将是这个公园的主角。他把众多科学家收归旗下,利用琥珀里面困住的远古蚊子体内的血液,提取出恐龙的基因信息,利用这些信息培育繁殖恐龙。结果如愿以偿,他在岛上建立成了一个恐龙公园,坚信可以从中赚取大钱。然而,科学家们则忧心忡忡。不幸的事情果然发生了。虽然公园有电脑系统管理,但却因为被员工破坏而造成了无法挽救的失控:所有的恐龙逃出了控制区,人们纷纷逃窜却逃不过恐龙的魔爪。恐龙自相残杀,人们亦死难无数,恐龙后续袭击一个工业园区时,一群衣衫褴褛的雇佣兵被召集进来。在他们摧毁该园区并逃往世界之前,将它们围住。并且设定了精密的计划来消灭这些变异的恐龙。最后幸存者寥寥,只得四人逃出生天。。一天名侦探毛利小五郎收到了一张寄给他的请帖,里面是一个神秘男子的委托,神秘男子邀请毛利小五郎等人前往横滨的一个游乐场。小五郎和江户川柯南一行人快乐地来到游乐场游玩,还带上了可以出入无阻的VIP手表。不料他们却中了那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场,否则手表上的炸弹便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点,如果柯南和小五郎不能解开谜题,小兰和少年侦探团也会随着游乐园一起粉身碎骨。其他侦探们与柯南一同挑战谜题,当所有人一起努力调查犯人的真面目时,危机却不断展露在眼前,时间一分一秒地逼近,犯人无赖地设下了最后一道陷阱。然而更意想不到的是,那名神秘男子居然直接称呼柯南为工藤新一,这到底是怎么一回事?。