1945年3月,美国盟军攻克科隆,救出了大批平民和战俘。卡尔的心情并没有因获释而放松,那些沉重、恐怖的画面不时浮上眼前,一段鲜为人知的历史在人们眼前展开:二战中后期,卡尔和弟弟彼得,以及带着孩子的寡嫂希里住在一座废弃公寓的地下室里。卡尔和几个朋友组成“雪绒花海盗”,专门救助当地平民,使他们远离战火的纷扰。有时他们会同纳粹儿童团发生冲突。彼得是纳粹儿童团一员,深受哥哥影响的他不喜欢战争,常在双方之间举棋不定。一日,卡尔他们发现一名受伤的战俘汉斯,将他带回家养伤。渐渐地,汉斯与希里间产生情愫。卡尔对此甚为不满,觉得这样对不起牺牲的哥哥。但汉斯认为自己可以照顾希里母子。两人于是结下宿愿。纳粹为引汉斯现身,绑架了希里母子,汉斯和卡尔等人前往营救未果。汉斯还为此受伤,彼得一直陪在他身边。迫切想结束汉斯带来的这种不安定生活的卡尔向纳粹告发了汉斯。作为条件,他希望...。2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案,实习记者城户真司为了调查此事,前往其中一个受害者的家中调查,并在房间内发现了一个名为卡片套匣的道具。为了阻止镜中怪物袭击人类,真司情急之下使用卡片套匣的力量变身为假面骑士前往了怪物所在的镜中世界,并认识了另一位假面骑士秋山莲和神崎士郎的妹妹神崎优衣。随后真司才得知了卡片套匣的秘密以及围绕着神崎士郎所进行的13位假面骑士之间围绕着自己愿望的战斗——最后活着的假面骑士可以实现自己的愿望。
在与镜中怪物订下契约后,成为假面骑士龙骑的城户真司决心为了消灭怪物、保护人类而战,同时也想阻止其他假面骑士自相残杀。
战斗愈演愈烈,神崎士郎的阴谋与真正目的逐渐浮出水面,真司将做出怎么样的决定?其他的假面骑士们又将何去何从?。