第二集中,尼奥(基努·里维斯 Keanu Reeves 饰)没有能从内部摧毁“母体”,他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷,思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带,这个地方由“火车人”控制。墨菲斯(劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰)和崔妮蒂(凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰)等人知道了尼奥的情况,在守护天使的带领下, 找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇,经过一番激斗,将尼奥救了出来。
此时,电子乌贼部队对锡安发起了猛烈的攻击,人类组织所有机甲战士展开顽强的抵抗,形势危在旦夕;尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船克服重重困难,到达机器城市,尼奥终于见到了机器世界的统治者“机器大帝”,双方谈判并达成了协议:尼奥除掉不受“母体”控制的史密斯,以换取锡安的和平。
在“母体”中,尼奥和史密斯展开了关系人类生死存亡的最后决斗。。幸福家园四号楼三单元201、202和三单元的门头房里,盘踞着老马家爷孙四口,每个人都有自己心中向往的桃花源。爷爷马天明希望攒更多养老钱,给窝囊废孙子孙女婿一条后路;孙子马岱想靠自由职业程序员之路,永远大门不出却衣食无忧;姐夫范程远梦想走出家门,成为知名学者;姐姐马桃想要让企业做大做强,创业合力电器…日子一天天过去,每个人都在一本正经地与自己的心愿背道而驰… 加上爷爷推拿馆的徒弟金大海、求合租的淘宝主播彭薇薇、楼上楼下形色各异的邻居们,回迁房小区里,上演着一宅家族最普通的琐碎日常,却也是最令人向往的生生不息……。