女医生蕾切尔惊闻三年未见的哥哥大卫在约旦过世,于是作为唯一亲属跟随美国国务院官员杰克前往约旦确认遗体。当她到达约旦却发现身为考古爱好者的大卫的死亡极为蹊跷,并且仿佛与失落的古文明“死海古卷”有关。蕾切尔决意调查事情的真相。杰克一方面为了保护蕾切尔的安全,一方面受命上级的要求,遂与蕾切尔一同追查“死海古卷”的下落。二人远赴迪拜,见到大卫生前最后试图联系的古董收藏家,获悉线索后又重回约旦追查。然而,想要得到古卷的还有一伙极端分子。蕾切尔与杰克经历追杀、绑架,甚至险些迷失在沙漠中,终于逃出生天。惊魂甫定,蕾切尔灵光一现,领悟到大卫想要传达给自己的信息,并顺利得到古卷,却没想到再次落入极端分子的圈套。蕾切尔与杰克冒着生命危险,制服恶徒,保护古卷,最终按照大卫的遗愿将古卷在博物馆展出,以供考古研究。他们二人也在经历生死后对彼此产生依恋。。影片背景设置在11世纪的波斯,一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身份,加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他的老师名叫阿维森纳,是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种,最著名的有《哲学、科学大全》,在当时是高水平的百科全书;另一部 巨著是《医典》,直到17世纪西方国家还视为医学经典,至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构,展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。。