在未知生命体全部被消灭后的两年,人类迎来了短暂的和平。但海滩上突然出现的神秘欧帕兹,打破了这一和平。城市中再度出现了人类离奇死亡的案件,这次残杀人们的凶手是新的敌人——不明物体。它们拥有着人类无法匹敌的神秘力量,就连专门为之成立的G3小队也对它们毫无办法。
失去记忆的开朗少年津上翔一,暂住在美杉教授家中,与美杉教授的侄女风谷真鱼、儿子美杉太一一起生活。但隐藏在翔一天真笑容背后的,其实是神秘的英雄——假面骑士亚极陀。每当不明物体出现残杀人类时,他便会受到感应前去消灭它们。
愈发强大的不明物体、津上翔一过去的记忆以及从欧帕兹中诞生的神秘黑衣少年,它们之间有着什么样的联系呢?一切的真相又是什么?。抗日战争爆发后,日军得寸进尺,大肆杀害抢掠我国同胞,人民恨之入骨,可惜孤军势弱奈侵略者不得。日军挺进中原,先头部队来到必经要塞:麦家村。
日军队长野田一郎原以为小小麦家村,面对日军金戈铁马的机械化部队,应该束手就擒,就此沦陷。岂料,在最危急时刻,麦包父亲联络邻村村民,共组游击队,运用硝、硫、木炭自制火药,制造地雷,顽强反抗。一时间,日军屡屡败退,对于麦家地雷,更是闻风丧胆。野田老奸巨猾,决定大肆抓捕中国人,威逼个别懦弱之徒做汉奸,混入麦家村游击队中,里应外合,大破地雷阵机灵敏捷的麦包人小志大,欲与麦父并肩作战,但被父亲制止,认为麦包应该读书识字,将来会更有一番作为。麦包一心报国,跟随爷爷的戏团混入日军所在的梁城演出爱国剧目《精武门》,唤醒人民沉睡的爱国心,不幸被抓。狱中,麦包遇到伪装成大汉奸打入敌人内部的共产党员徐三东。在三东的帮助下,麦包死里逃生,更成为了一名小小小卧底……。北京猿人头盖骨的发现震惊世界,也引起了日本侵略者的觊觎,他们制定了抢夺计划,准备将其据为己有。为此中美两国商议制定了秘密转移计划,代号:军刀。爱国医生刘云翔的父亲在行动中不幸遇害并被诬陷为监守自盗,为替父雪耻,找到真凶,刘云翔误打误撞进入了军刀行动中。日军的凶残和贪得无厌令刘云翔厌恶万分,共产党员为保护国宝而英勇献身的壮举让他充满敬意。在北平地下党的帮助下,刘云翔最终完成了从自发替父报仇到自觉地用生命保护国宝的转变,并凭着他过人的智慧和勇气,粉碎了日军妄图掠夺国宝的阴谋。他也在血与火的斗争中光荣地成为了共产党员并收获了自己幸福的爱情。。