成功营救药老后,重伤的萧炎被带回星辰塔闭关。得益于三千焱炎火和星辰之力的修复,沉睡了一年的萧炎终于苏醒,并晋升为斗尊。为了修复药老的本源魂气,萧炎决定前往远古时期斗圣留下的遗迹。然而,无数势力都觊觎此地的天阶斗技和斗圣骸骨,在遗迹未开启之前,已经有多方势力汇聚于此,所有人都想分一杯羹。与此同时,魂殿的威胁也迫在眉睫,萧炎唯有火中取栗,方可博得一线生机。。基因石被毁,不料基因石能量逸出,飘散到地球各处,引发了异常现象:森林树木变得更茂密,湖泊海洋闪发着光,电力强化导致设备爆炸。由于基因源事故,武装战士变成变形机甲、生物进化为虫族、浩肯星人异化为变异战士,故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。。