某个黑夜,一名间谍潜入日本警察机关企图盗取一份机密文件,这份文件内容中含有英国“MI6”、德国“BDN”、美国“CIA”,甚至还有“FBI”等各国谍报机构的相关人员名单。千钧一发之际,安室透率领的日本公安赶到,间谍夺车逃跑,高速公路大桥上上演激烈追逐战,其他的车辆也被卷入其中,眼看要酿成惨重事故的瞬间,间谍的车被FBI赤井秀一用来复枪射中,从大桥坠入海中。
第二天,柯南等人来到东都水族馆游玩,他们在巨大摩天轮底下,发现了一位独自一人又负伤的漂亮女子,仔细一看她的两只眼睛的瞳孔颜色不一样,也就是俗称的“阴阳眼”。可是,这位女子已经是连自己名字都不记得的失忆状态,带的手机也已经损坏。为了帮助她找回记忆,柯南等人约好了和她同行。没想到,这一切都被贝尔摩德暗中监视着……。悠利(早见沙织配音)的父母在意外中不幸离世,这场悲剧让这个少年天真无邪的脸上平添了忧郁。一天,一个名叫凛凛澄(高桥李依配音)的女仆突然出现在了悠利的面前,要认他做主人。 刚开始,来历不明身份成谜的凛凛澄让悠利十分的戒备,可随着时间的推移,凛凛澄所展现出来的高超家务技巧和极为出色的厨艺很快就征服了悠利,就这样,悠利和凛凛澄开始了居住在同一屋檐下的日子。他们之间奇怪的主仆关系吸引了千金大小姐五条院司(堀江由衣配音)的注意,生性浪漫的她对于悠利和凛凛澄之间的关系充满了不切实际的幻想。。