西历2071年,迷之机械细胞群突然开始了世界规模的人类讨伐作战计划。2074年,经过长期抗战之后,处于劣势的人类动用了最终破坏兵器,为了歼灭敌人,甚至不惜付出牺牲自己国家庞大国土的代价。于是主要大陆被分成了数块,南极大陆也消失了,地球上的50%以上的陆地被海水所淹没。大战经过了十年后…… 原本在大战中受伤而退伍不再当飞行员的冬后大佐,却突然接到了特殊命令。负责教育驾驶日本海军机密研发的、汇集了所有最新设计理念的新武器的飞行员们。令人惊讶的是,这三名飞行员候补生都是十几岁的女孩子。精英军人家庭中成长的一条瑛花也就算了,看着与战争看起来扯不上边的IQ200的天才少女园宫可怜、以及看起来唯一的优点就是有精神的少女樱野音羽这两个人,冬后哑口无言……在严酷的训练中,三人之间的羁绊也越来越深了。 被称为“SKY GIRLS”的少女们,背负着人类的未来和希望。现在...。Satan破解心率锁,得到全球人口数据云库,他的方舟计划得以继续进行,40亿生命危在旦夕!然而又一道算法公式阻止了Satan,数据云库已被加密,破解算法的方法竟然在北奥统一考试的试卷上。苏醒后的阿J决定参加考试,抢在Satan之前破译算法。 谁也没有想到的是,阿J因为昏迷太久,被诊断患有数字过敏症,无法再接触与数学有关的任何东西。 方舟计划还在进行,Satan步步逼近。阿J能否战胜心魔,挽回已经失衡的天秤?。东京连续发生数起离奇命案,所有尸体上皆刻上“X”符号,而在场的嫌犯都不记得自己所为,这令警察们大为困惑。刑警高部(役所广司饰)断定有人利用催眠术行凶,一名在海岸徘徊的半失忆青年间宫(荻原圣人饰)成为怀疑重点,与该青年接触过的教师、警察和女医生都这样杀了人。
随后高部着手对间宫进行审讯,却总被他的言语打乱,调查毫无进展,再加上妻子因精神疾病住院,高部的情绪变得极为糟糕。高部的朋友心理学家佐久间劝他不要再和间宫接触,自己却被无意识使用催眠术的间宫逐渐操控。不久后,间宫从精神病院逃走,而佐久间被发现自杀身亡。高部来到以前间宫提过的一间废弃小屋中,遇到了间宫并将他杀死,对方满足地死去。然而一切并没有就此结束……。