黎若幼时丢失被首富收养,但再找回亲生父母时却发现亲生父母误以为收养她的是农民,偏袒假千金,假千金更是设计黎若,想把黎若赶出家门,黎若见招拆招,在养父母家人的帮助下打脸假千金并最终揭示自己是被首富收养。。一对夫妇被一只怪物残忍的杀害了,警察没能抓到怪物,随后案子也不了了之。幸运的是,这对夫妇的两个孩子都没有受外伤。四岁的女儿泰瑞被一户人家收养,八岁的阿历克斯因为精神上受到打击,因此住进了精神病院进行治疗。十九年过后,泰瑞的养母临死前告诉了她从小被收养的事实。泰瑞想要找到哥哥阿历克斯问清当年凶杀案的真相,没想到更可怕的事实随之付出水面,阿历克斯似乎与那只怪物有着密不可分的关系……。突袭世界的大灾难“第二次冲击”后,世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他,却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下,特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下,并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的,却是是父亲冷酷地命令:驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。
本已表示拒绝的真嗣,看到重伤的替补驾驶员绫波丽后,决定遵从父亲的命令。就这样,从未受过作战训练的真嗣,准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
世界的命运托付在了一位年仅14岁的少年身上,而“第二次冲击”所隐藏的“人类补完计划”似乎也开始了行动。掌握一切答案的碇元渡,却只是不动生色地观察,仿佛一切早已写入剧本。。