扣人心弦的《血色星期二》第二部再次席卷而来。天才黑客高木藤丸(三浦春马 饰)这次又会遇到什么棘手的问题呢?
第一部的最后,藤丸和其朋友力挽狂澜地阻止了病毒危机。而这次他们面临的则是更加令人恐怖的核弹恐怖计划。在病毒危机结束后两年,受其影响的藤丸决定再也不碰电脑,可是他还是不能组织自己和朋友九条音弥(佐藤健 饰)、高木遥(川岛海荷 饰)被卷入到新的计划当中。载有核弹的飞机正在一点点向东京逼近,而东京的群众却毫不知情,为了避免东京遭受到核弹的重创,藤丸和音弥不得不继续开始奋战。而他们所面对的除了老对手折原玛雅(吉濑美智子 饰)和神崎润(成宫宽贵 饰)外,还有许多新人。而结果究竟如何呢?。达明遇到神秘少女安安,被穿越时空来到清朝,被逼无奈之下,要在清朝以宋世杰的名义打官司,使得虚构人物宋世杰成为真实的存在。而安安的目的更是希望以此令到现实的达明与虚拟世界的宋世杰打通一座穿越两个世界的桥梁,从而让养父找到办法虚拟世界,与自己的爱人一家团聚。时空修复师薛引来到,试图阻止,与穿越者安安斗智斗勇,更在一捉一放,一打一闹间留下无尽暧昧。可是二人争斗中无意间却令大清朝混入了开膛手杰克。杰克如鱼得水,大开杀戒。而另一边达明和宋世杰已经浑然一体,翻案成功,世杰世上留名,更因此而产生了新的平行宇宙,可是安安不属于这个世界,生命危在旦夕!最后一刻,修复师薛隐舍身引开开膛手杰克,令时光倒转。。