这部《雄霸天下》的故事紧接《岁月风云》展开。陆云生(吕良伟 饰)场面做大,他为人重情义不计开销导致入不敷出,遂计划涉足银行业,岂料上海各银行家集体抗拒。陆请动古羽(苗侨伟 饰)协助,终令银行家们低头服输……1937年,政府推行“新生活”运动,陆云生放弃鸦片生意带头戒毒,结果险些丧命,不久卢沟桥事变爆发,陆云生为支持抗战捐赠战机,却仍没有挽回上海沦陷的结局,是役更导致他众多门生身亡。陆云生为躲避日本人暂居香港,期间黄金荣(郑则仕 饰)留沪装傻;袁肃军(徐锦江 饰)投靠日军成为汉奸,陆云生只得派出阿山(汤镇业 饰)刺袁。
抗战终于胜利,陆云生有望成为上海市长,让他颇感欣慰,但冷酷的现实是他已失去利用价值,一代枭雄在不属于他的时代渐入穷途……。九河下稍,民国津城,“小河神”郭得友(金世佳饰)、“漕运大少”丁卯(张铭恩饰)继续追查恶水之源爆炸迷案,岂料崔疯子化骨身死,外交官自燃焚亡,海河里冲出水下墓冢……桩桩大案接踵而至,一时间天津卫满城风雨、人心惶惶。在此期间旧人深陷囹圄,新人粉墨登场,案件的背后天津卫盘根错节的政商关系昭然若揭,而关于“九牛二虎一鸡”的惊天秘密也逐渐浮出水面,且看郭、丁二人能否揭秘追凶、再续传奇。 该剧改编自天下霸唱小说《河神:鬼水怪谈》。。抗战时期,珠宝商韩天奎和女儿韩大珠将商会同仁捐献给抗日将士的一箱珠宝存放在刘善朴的当铺内,同时韩天奎将一把短剑作为信物,约定取货之时只认剑、不认人。
韩天奎在回家的路上不幸被杀,短剑也落入东湖水中,女儿大珠死里逃生。大珠和妹妹小珠请来船工赵通海前往东湖打捞短剑。大珠记得出事当天,岸边曾有一僧尼,姐妹俩找到僧尼慧琛,请师傅说出短剑的下落。慧琛认清大珠后,约于次日清晨阉前见。当晚慧琛发现数人被害,心知不妙,翌日匆匆指出短剑的位置,便离开了碧云庵。然而,在慧琛大师所指的位置,大珠仅仅只打捞出剑鞘,却怎么也捞不到短剑。此时岸上一帮歹徒逼来,要他们交出短剑。一场激战,歹徒被击退后,大珠再次找到慧琛,慧琛知道短剑来由后,遂让弟子取出,原来短剑已被慧琛捞起。
三人直奔刘善朴家,开门的竟是湖边夺剑的歹徒,又是一场激战。大珠终于费尽周折,找到了刘善朴,于是当场焚香试剑,两剑相斥,无可非议。正当三人往外走时,刘善朴女儿刘小玉赶来告诉他们院内有埋伏。一阵枪响过后,小玉倒在血泊之中。小玉同学王长贵在刘家小住,一日晚上意外的发现刘善朴原来是日本间谍,他把这个消息告诉了刘善朴的家丁。此刻家丁们才恍然大悟是被日本人所利用。大珠、赵通海一行和王长贵等人最终杀死了刘善朴,夺回了珠宝。。