某夜,云城千金沈之念家中突逢巨变,双亲在她眼前被杀!丈夫救她而亡!她悲痛万分从噩梦中醒来,却发现,殒身于大爆炸的丈夫竟好端端的的出现在她面前?她欣喜万分,而后,她惊觉,不!这所谓的丈夫是那个杀人凶手!。同村的张广发与张富贵素有积怨,互看不上,两人的儿子还都叫张伟。一天,村长接到派出所的电话,说张伟打人被抓,但并不知是哪个张伟。于是,二人一同上路,前往北庭市东门派出所一探究竟。张广发是村里的治保主任,认为被抓的绝不可能是自己的儿子,而张富贵虽不愿接受这个“真相”,但也逐渐认为很可能就是自己的儿子,于是十分沮丧。
二人到达县城,坐反了公交,辗转多时终于到达派出所,却被告知因警官全部出警,今日不能见到被抓的儿子。二人试图拿出临行前本意买“桂烟”却被小卖部老板娘误给的五十块“贵烟”“贿赂”民警,无果,只得走出派出所等待。二人溜达至天桥,遇到一位“算命先生”,其实是个骗子,张广发及时报了警,才免得被骗钱财,还因举报获得了二百三十元奖金。又过了多时,二人终于见到警官,却被告知被抓的人下午就走了,但是电脑里有照片,二人探身一瞧,张广发傻了眼,张富贵却笑了,打人的竟是张广发——治保主任的儿子。
张广发“跋扈”的气焰逐渐消散,二人坐在体育馆门前的台阶上,等待张富贵的儿子来。父子二人相见后的拌嘴与互相埋怨实则满含深情,张广发十分羡慕,暗自落寞。一顿自助火锅后,张富贵让儿子带着他赶快去车站买票回家,免得被张广发抢了先。却无意中看到张广发正在前往五羊的大巴车前检票,于是赶忙买了同一车次的票,上了同一辆车。到达五羊后,张富贵逐渐得知了张广发家中的秘密,二人也在朝夕相处中达至和解。张广发的儿子张伟幼时走丢,偶然被告知车站有一酷似自己儿子的小孩,张广发与妻子连忙赶到,三人相拥而泣。但张广发从一开始便知晓这并不是自己的亲生儿子,怕妻子和儿子伤心便将秘密藏入心底。时隔多年,父子俩人因事争吵,张伟一气之下离家出走,夫妻二人再度踏上找寻儿子的路程。此后偶然得知,妻子和儿子均早就知晓“并非亲生”这一事实,且都怕伤害彼此而选择隐藏真相。
二人继续踏上旅途,为了在公路上搭车而闹尽“洋相”,还不小心撞死了一只羊。最终于偶然之间,终于在北山一家饭馆找到了张伟。张广发意图离去,张富贵却大声呼喊,促成了父子相见。父子二人诉说过往,冰释前嫌,一家人由此团聚,隔日便驱车,在阳光明媚的日子里,一同前往回家的方向。。位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人,其中约8成是学生的这座都市中,实施着超能力开发的特殊课程,学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。
高中生上条当麻,也是住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的力量——只要是异能之力,就连神的加护都能消除的“幻想杀手Imagine Breaker”,而被评价为名落孙山的“无能力”,过着充满不幸的人生。
而上条的学生生活,由于暑假开始时从天而降的纯白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇开始,上条就被卷入了各种各样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法”方,在惊险地解决双方事件的过程中,他的人际关系也逐步扩展。之后,魔法一方的十字教最大宗派罗马正教,终于注意到上条的存在……。
如同呼应魔法方一般,科学方的学园都市也有所动作。但也有与逐渐开始对立的世界动向抗争的人不断出现。那些通过与上条有所关联,而使命运大为改变的“英雄”们。
他们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。
科学与魔法第三次交织之时,故事将大幅推进!!。